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生物体中的RNA种类繁多，功能复杂，一般按照是否编码蛋白质将其分为编码RNA（coding RNA）和非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）两大类。前者就是指mRNA，后者则包括很多种类，如众所周知的tRNA和rRNA，参与mRNA剪接的snRNA，参与RNA修饰的snoRNA等。
非编码RNA种类很多，按照长度可分为两大类：大于200 nt（核苷酸）的称为长非编码RNA（lncRNA），小于200 nt的称为小非编码RNA（small ncRNA），50 nt以下的还可称为tiny ncRNA，如siRNA、miRNA和piRNA等。
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