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自然情况下，DNA聚合酶将一个核苷酸渗入到DNA分子中就会释放出一个H+，导致局部可检验的PH值发生变化。如果发生结合，就会释放H+,相应的溶液PH值会发生改变，被离子传感器检测到，从而转换为数字信号。
如果检测DNA链上有两个相同的碱基，检测到的电压双倍，芯片则记录两个相同的碱基。
如果模板到的下个核苷酸与微芯片流的核苷酸不匹配，则检测不到电压，也不会记录碱基。
